O laboratório de Controle de Qualidade de Hemocomponentes, implantado em agosto de 2003, realiza rigorosos testes de qualidade, conforme exigidos pela legislação vigente, nos hemocomponentes processados e transformados em todos os laboratórios de Processamento, visando garantir a qualidade do sangue durante a coleta, processamento, armazenamento, distribuição e transfusão.O laboratório dispõe de um sistema automatizado de detecção bacteriana e realiza testes de hematócrito, grau de hemólise, dosagem de hemoglobina,  volume, contagem de células, pH e fatores de coagulação.

Além disso, este laboratório também é responsável pela validação de insumos e equipamentos utilizados pelos laboratórios de Processamento em todos seus processos.

O laboratório de Controle de Qualidade é certificado pelo controle de qualidade externo da ControlLab®.